所徽的設計理念如下：

所徽外圈的刻度是羅盤的刻度，象徵本所是GIS系統教學與研究的重鎮；中間綠色的部分為竹簡，象徵本所研究由傳統文本走向數位文本的轉換；竹簡上的點和線，則是象徵本所進行的社會關係網絡研究；本所徽涵蓋了「文本分析」、「地理資訊系統」與「社會關係網絡」等三大數位人文研究領域，亦是本所未來將努力邁進的理想與目標。