本所最低畢業學分為 27 學分（不含論文指導一、二 6 學分，教育學分另計），課程規劃成四大部分：

一、必修課程：3 學分 歷史地理與史學研究方法（3 學分）。

二、大眾史學領域：共 12 學分

三、歷史地理學領域：共 6 學分

四、數位人文領域：6 學分

※為加強日文能力，碩一開設日文(一)、(二) 各 3 學分、碩二開設日文史學名著選 讀(一)、(二)各 2 學分，以上不列入本所最低畢業學分。